Комплекс оборудования лаборатории обеспечивает проведение исследований с целью разработки новых подходов для оценки состояния и мониторинга водных экосистем на основе изучения качественного и количественного состава природных метаболитов и выявления закономерностей их изменения в зависимости от условий окружающей среды.

Имеет высокую селективность с высоким разрешением по массам. Включает в себя газовый двухканальный хроматографTrace Gc Ultra и масс-спектрометрический детектор ISQ с диапазоном масс 1,2 -1100 а.е.м. Рабочий диапазон температур: (от t окружающей
среды +50С) до 4500С.
Предназначен для определения широкого спектра низкомолекулярных органических соединений различной природы, содержащихся в водных объектах с целью расшифровки конкретных веществ по масс-спектрам.

Универсальный цифровой микроскоп с различными телецентрическими зум-объективами с диапазонами увеличений от 100х до 1000х, 250х до 2500х, от 500х до 5000х.
Предназначен для аналитических исследований с возможностью автоматического получения трехмерного изображения и измерений в 2 D и 3 D в реальном времени.

Имеет электротермический атомизатор со спектральным диапазоном 180 - 900 нм для определения валового содержания микроэлементов в природных водах. Двухлучевая оптика Стокдейла. Электротермический атомизатор: максимальная
температура - 3000ºС.

Многопараметрический автоматический зонд YSI 6600 V2-03 фирмы YSI Incorporated,
с датчиками электропроводимости (солености), температуры, глубины до 200 м, и др. параметров с возможностью подсоединения до 9 датчиков (всего), включая 4 оптических.
Предназначен для исследований в полевых условиях для автоматического определения серии лимнологических параметров и качества воды на глубинах до 200 м, состава веществ с неизвестными концентрациями.